Em todo o caso é uma questão de ir à Pasta Pessoal e apagar as pastas ocultas de aplicações que já não interessam. Em todo o caso, em termos de programas o Ubuntu Tweak faz algumas coisas interessantes, nomeadamente apagar pacotes desnecessários e limpar caches. Existe também o Bleachbit, mas não tenho muito contacto com ele:
Quanto ao Firebug, já li uma vez que era das extensões mais pesadas que o Firefox tem (das conhecidas claro). Por isso essa queixa pode estar muito relacionada com ele.